Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PTPRCP08575 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRCP08575 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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