Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01800 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01800 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01800 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01800 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01800 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01800 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01800 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01800 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01800 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01800 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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