Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lnx1O70263 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lnx1O70263 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms