Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctnnd2O35927 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctnnd2O35927 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctnnd2O35927 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ctnnd2O35927 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ctnnd2O35927 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms