Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Sp100O35892 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sp100O35892 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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