Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
BC117090L7N257 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms