Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Smim18J3QNP2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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