Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20828J3KMI7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm20828J3KMI7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20828J3KMI7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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