Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vmn1r34G3XA52 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vmn1r34G3XA52 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms