Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8247F6VRJ8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms