Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms