Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm6880A3KG45 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm6880A3KG45 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Gm6880A3KG45 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm6880A3KG45 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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