Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc183A2AJB1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc183A2AJB1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms