Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms