Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cpne6Q9Z140 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cpne6Q9Z140 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cpne6Q9Z140 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms