Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Tomm40Q9QYA2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tomm40Q9QYA2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms