Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChmQ9QXG2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms