Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms