Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Swt1Q9DBQ9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms