Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms