Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q9D8N1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D8N1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms