Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Exosc7Q9D0M0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms