Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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