Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chmp3Q9CQ10 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms