Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms