Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Slc8b1Q925Q3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Slc8b1Q925Q3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Slc8b1Q925Q3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Slc8b1Q925Q3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Slc8b1Q925Q3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms