Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hoxc12Q8K5B8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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