Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c1Q8K193 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms