Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Usp27Q8CEG8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp27Q8CEG8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp27Q8CEG8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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