Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ubash3bQ8BGG7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms