Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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