Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Eci3Q78JN3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Eci3Q78JN3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms