Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttbk1Q6PCN3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttbk1Q6PCN3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms