Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp49Q6P9L4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms