Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms