Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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PcolceQ61398 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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