Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cln3Q61124 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cln3Q61124 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms