Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms