Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sec31aQ3UPL0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms