Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp19Q3UJD6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp19Q3UJD6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp19Q3UJD6 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Usp19Q3UJD6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp19Q3UJD6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp19Q3UJD6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp19Q3UJD6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp19Q3UJD6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp19Q3UJD6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms