Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Puf60Q3UEB3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Puf60Q3UEB3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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