Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ssbp4Q3U4B1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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