Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms