Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms