Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc69Q3TCJ8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc69Q3TCJ8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms