Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc39dQ0VF76 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms