Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
MitfQ08874 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms