Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kcnma1Q08460 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Kcnma1Q08460 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Kcnma1Q08460 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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