Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gjb5Q02739 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms