Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd1Q01822 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd1Q01822 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms